System monitorowania opracowany przez Uniwersytet Medycyny w Pittsburghu skutecznie wykrył wybuch zakażenia odpornego na leki, przenoszonego za pomocą kropli do oczu, kilka miesięcy wcześniej niż potwierdzili to ogólnokrajowi urzędnicy zdrowia publicznego. System o nazwie Enhanced Detection System for Healthcare-Associated Transmission (EDS-HAT) wskazał przypadki zakażenia w szpitalu UPMC i pokazał potencjał sekwencjonowania całego genomu do wykrywania i powstrzymywania wybuchów zakażeń szybciej.
Sekwencjonowanie całego genomu to technologia, która analizuje unikalne odciski DNA patogenów w próbkach pacjenta. Porównując kod genetyczny z próbek różnych pacjentów, badacze mogą określić, czy istnieje bliskie dopasowanie, wskazujące na wybuch. Wykorzystanie sekwencjonowania całego genomu pozwoliło badaczom zidentyfikować wybuch zakażenia odpornego na leki związanego z użyciem sztucznych łez.
UPMC jest jednym z niewielu systemów szpitalnych w USA, które wykorzystują sekwencjonowanie całego genomu w ten sposób. W październiku 2022 roku UPMC wykryto dwa przypadki zakażenia odpornego na leki za pomocą EDS-HAT, choć nie było oczywistego związku między pacjentami. Jednak gdy CDC podzieliło się kodem genetycznym, odkryto, że oba przypadki były częścią wybuchu związanego ze sztucznymi łzami.
Dalsza analiza sekwencji genetycznych wykazała, że pochodzenie bakterii można prześledzić na próbkach zebranych w 2013 i 2018 roku z Indii i Nigerii. Wyniki sugerują, że krople do oczu były prawdopodobnie skażone w zagranicznym zakładzie produkcyjnym. Te informacje można było wykryć dużo wcześniej, gdyby więcej szpitali korzystało z monitorowania sekwencjonowania całego genomu i dzieliło się wynikami z centralną bazą danych publicznych.
Zespół badawczy podkreśla znaczenie wdrażania tej technologii w szpitalach, aby skuteczniej wykrywać i zapobiegać wybuchom. Dzięki wykorzystaniu monitorowania sekwencjonowania całego genomu, szpitale mogą szybciej identyfikować i reagować na wybuchy w swoich murach. Ponadto, dzielenie się tymi danymi z innymi szpitalami i władzami zdrowia publicznego może pomóc powstrzymać ogólnokrajowe wybuchy.
Studium podkreśla potencjał systemów monitorowania chorób zakaźnych i rolę sekwencjonowania całego genomu w wykrywaniu i zapobieganiu rozprzestrzenianiu się zakażeń odpornych na leki.
Źródło: The Journal of Infectious Diseases
