W niedawno opublikowanym badaniu w czasopiśmie Journal of Hospital Infection, badacze przeprowadzili kompleksową analizę systemu ścieków w University Hospital Limerick w celu zidentyfikowania źródeł zakażeń i genów oporności na antybiotyki. Badanie wykazało, że dominujące mikroorganizmy w ściekach miały wysoki poziom genów oporności na antybiotyki, podkreślając znaczenie regularnego czyszczenia i dezynfekcji, aby zapobiec zakażeniom u pacjentów.
Oporność na antybiotyki stanowi poważne wyzwanie w opiece zdrowotnej, gdy infekcje wielolekooporne stają się coraz bardziej powszechne na całym świecie. Poprzednie badania wykazały, że zanieczyszczone umywalki do mycia rąk mogą przyczyniać się do wybuchów w szpitalach. Sądzi się, że urządzenia do odprowadzania ścieków od pacjentów mogą służyć jako rezerwuary dla genów oporności na antybiotyki (ARG) i mikroorganizmów powodujących zakażenia, co wymaga dalszych badań w celu zidentyfikowania tych rezerwuarów i opracowania skutecznych interwencji w celu kontrolowania zakażeń.
Celem badania było zrozumienie profilu taksonomicznego i resistomu systemu ścieków, ze szczególnym uwzględnieniem wybuchów szpitalnych infekcji wielolekoopornych. Badacze przeprowadzili szeroko zakrojoną analizę metagenomiczną mikrobiomu ścieków w dużym szpitalu uniwersyteckim o historii wykrywania opornych na antybiotyki drobnoustrojów i wybuchów zakażeń. Analizowali próbki rur pobrane z pokoi pacjentów przed wyremontowaniem oddziału szpitalnego oraz izolaty kliniczne od pacjentów, którzy nabawili się zakażeń opornych na antybiotyki podczas pobytu na oddziale.
Analiza wykazała szeroką różnorodność mikroorganizmów w umywalkach, podczas gdy w toaletach i prysznicach stwierdzono mniej zróżnicowane społeczności. Dominującymi typami bakterii w systemie ścieków były Proteobacteria i Actinobacteria. Chociaż różne profile mikroorganizmów były obecne w różnych próbkach, co świadczy o wpływie ludzkich zachowań i aktywności, profile ARG nie wykazały znaczących różnic między typami próbek. Sugeruje to, że geny oporności na antybiotyki są współdzielone przez różne gatunki bakterii, potencjalnie poprzez ewolucję dywergentną lub transfer poziomy.
Porównując profile próbek rur ściekowych i izolatów od pacjentów, badacze znaleźli podobieństwa i znaczną liczbę wspólnych ARG. Badanie podkreśla możliwość przenoszenia genów z systemu ścieków na pacjentów lub odwrotnie, podkreślając wzajemny wpływ klinicznie istotnych drobnoustrojów i mikroorganizmów obecnych w środowisku ścieków szpitalnych.
Podsumowując, to badanie uwypukla znaczenie identyfikacji i charakteryzowania rezerwuarów oporności na antybiotyki w szpitalach. Wykorzystanie metagenomiki dostarcza cennych informacji na temat genów oporności obecnych zarówno w izolatach środowiskowych, jak i klinicznych. Wyniki sugerują, że aktywne zarządzanie antybiotykami i ograniczenie stosowania szerokowachlarzowych antybiotyków mogą pomóc zmniejszyć obciążenie opornością na antybiotyki. Skuteczne polityki i interwencje są kluczowe dla kontrolowania przenoszenia zakażeń w szpitalach i łagodzenia występowania coraz bardziej opornych chorób.
Odwołanie do czasopisma: Large-scale characterisation of hospital wastewater system microbiomes and clinical isolates from infected patients: profiling of multidrug-resistant microbial species. Kelly, S.A., O’Connell, N.H., Thompson, T.P., Dillon L., Wu, J., Creevey, C., Kiely, P., Slevin, B., Powell, J., Gilmore , B.F., Dunne, C.P. Journal of Hospital Infection (2023).
