Dans une étude récente publiée dans le Journal of Hospital Infection, des chercheurs ont mené une analyse approfondie du système d’eaux usées de l’hôpital universitaire de Limerick afin d’identifier les sources d’infection et les gènes de résistance aux antimicrobiens (RAM). L’étude a révélé que les microbes dominants dans les eaux usées présentaient des niveaux élevés de gènes de RAM, soulignant l’importance du nettoyage régulier et de la décontamination pour prévenir les infections chez les patients.
La résistance aux antimicrobiens constitue un défi important dans le domaine des soins de santé, les infections à médicaments multirésistants devenant de plus en plus prévalentes dans le monde. Des études précédentes ont montré que les éviers de lavage des mains contaminés peuvent contribuer aux épidémies dans les hôpitaux. Il est présumé que les dispositifs d’eaux usées en contact avec les patients peuvent servir de réservoirs de gènes de résistance aux antimicrobiens (GRAM) et de microorganismes causant des infections, ce qui nécessite des recherches supplémentaires pour identifier ces réservoirs et informer des interventions efficaces pour contrôler les infections.
L’étude visait à comprendre les profils taxonomiques et résistomiques du système d’eaux usées, en se concentrant spécifiquement sur les éclosions d’infections nosocomiales multirésistantes aux médicaments. Les chercheurs ont réalisé une analyse métagénomique à grande échelle du microbiome des eaux usées dans un grand hôpital universitaire ayant déjà détecté des RAM et des éclosions. Ils ont analysé des échantillons prélevés dans les conduites des chambres des patients avant la rénovation de l’unité hospitalière, ainsi que des isolats cliniques de patients ayant contracté des infections à RAM pendant leur hospitalisation.
L’analyse a révélé une grande diversité microbienne dans les éviers, avec des communautés moins diversifiées dans les toilettes et les douches. Les principaux phyla présents dans le système d’eaux usées étaient les Proteobactéries et les Actinobactéries. Bien que différents profils microbiens soient présents dans les différents échantillons, ce qui démontre l’influence des comportements et des activités humaines, les profils de GRAM n’ont pas montré de différences significatives entre les types d’échantillons. Cela suggère que les GRAM sont partagés entre différentes espèces bactériennes, potentiellement par le biais d’une évolution divergente ou d’un transfert horizontal.
En comparant les profils des échantillons prélevés dans les conduites d’eaux usées et des isolats de patients, les chercheurs ont trouvé des similarités et un nombre significatif de GRAM partagés. L’étude a souligné la possibilité de transmission de gènes du système d’eaux usées aux patients, ou vice versa, mettant en évidence le croisement entre les pathogènes cliniquement pertinents et les microbes présents dans les environnements des eaux usées hospitalières.
En conclusion, cette étude souligne l’importance d’identifier et de caractériser les réservoirs de résistance aux antibiotiques dans les hôpitaux. L’utilisation de la métagénomique permet d’obtenir des informations précieuses sur les gènes de résistance présents à la fois dans les isolats environnementaux et cliniques. Les résultats suggèrent que la gestion active des antimicrobiens et la réduction de l’utilisation d’antimicrobiens à large spectre pourraient contribuer à réduire le fardeau de la RAM. Des politiques et des interventions efficaces sont essentielles pour contrôler la transmission des infections dans les hôpitaux et atténuer l’émergence de maladies plus résistantes.
Référence de l’étude : Caractérisation à grande échelle des microbiomes du système d’eaux usées hospitalières et des isolats cliniques de patients infectés : profilage des espèces microbiennes multirésistantes aux médicaments. Kelly, S.A., O’Connell, N.H., Thompson, T.P., Dillon L., Wu, J., Creevey, C., Kiely, P., Slevin, B., Powell, J., Gilmore , B.F., Dunne, C.P. Journal of Hospital Infection (2023).
