La estructura de las proteínas es esencial para su función, ya que determina los pliegues y bolsillos que permiten que las proteínas impulsen reacciones químicas y se unan a moléculas específicas. Sin embargo, cada vez se comprende más el papel de las proteínas inheremente desordenadas, que carecen de una estructura establecida y contienen secciones flexibles que son críticas para su función. El desafío ha sido determinar si estas proteínas adoptan temporalmente una estructura específica o si su desorden es necesario para su función.
Un estudio reciente exploró la interacción entre dos proteínas inheremente desordenadas, la proteína 4.1G y NuMA, las cuales son cruciales para la división celular. Los investigadores deseaban entender cómo funcionaban estas proteínas a pesar de su falta de estructura establecida. Un enfoque involucró mutar una de las regiones inheremente desordenadas y analizar el efecto en la interacción. Al unir la región a una proteína que cataliza una reacción química, los investigadores pudieron determinar qué ubicaciones específicas en la región desordenada eran esenciales para las interacciones.
Otro enfoque utilizó simulaciones de dinámica molecular, las cuales predicen estructuras proteicas basadas en características físicas. Sin embargo, estas simulaciones revelaron que la región inheremente desordenada de la proteína alternaba entre 15 conformaciones diferentes en un corto periodo de tiempo.
Para obtener más información sobre la estructura de la proteína, los investigadores recurrieron al software de inteligencia artificial AlphaFold de Google. Utilizaron AlphaFold para predecir la configuración del complejo proteico y probaron su precisión al compararla con las mutaciones identificadas en los experimentos anteriores. La estructura predicha mostró una interacción de tres láminas de aminoácidos de ambas proteínas, lo cual explica por qué las proteínas permanecen desordenadas fuera del complejo. Esta estructura no puede formarse sin la presencia de ambas proteínas.
Este estudio resalta la importancia de las proteínas inheremente desordenadas en la estructura y función de las proteínas. Al utilizar diversas técnicas experimentales y computacionales, los investigadores están obteniendo una mejor comprensión de cómo operan estas proteínas. Los hallazgos contribuyen al campo más amplio de la determinación de la estructura de las proteínas y brindan información sobre los mecanismos complejos que impulsan los procesos celulares.
Fuentes:
– Artículo original: [Título del artículo de origen]
– AlphaFold: [Proporcionar información de fuente para AlphaFold, pero eliminar la URL]